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临床医学正高级职称与教授职称在体系上存在差异，具体区别如下：

一、职称体系分类

1. 临床医学职称体系

   包含住院医师（初级）、主治医师（中级）、副主任医师（副高级）、主任医师（正高级）四个等级，对应医学专业技术职称。

2. 教育体系职称体系

   包含助教（初级）、讲师（中级）、副教授（副高级）、教授（正高级）四个等级，属于高教职称序列。

二、职称与学术头衔的对应关系

• 临床医学正高级职称 ：主任医师

• 教育体系正高级职称 ：教授

关键区别 ：临床医学正高级职称（主任医师）与教育体系中的正高级职称（教授）是两个独立体系，分别针对临床实践与教学科研能力。

三、其他说明

• 教授职称 ：在教育体系中属于最高职称，需承担教学、科研等任务；在临床体系中，主任医师是最高职称。

• 临床医学职称晋升条件 ：需通过职称评审，侧重临床经验、科研成果（如论文、项目）等。

结论 ：临床医学正高级职称（主任医师）与教授职称在层级上不对应，前者是临床领域的最高职称，后者是教育领域的最高职称。