迟到被扣钱后辞退是否有补偿，取决于员工迟到行为的严重程度以及公司辞退行为的合法性。如果迟到行为未达到严重违反公司规章制度的标准，或者公司未履行明确告知和处罚程序，员工被辞退后可以要求经济补偿。以下是具体分析：

1. 迟到行为是否严重违反规章制度

• 根据《劳动合同法》第39条规定，用人单位可以解除劳动合同的情形包括严重违反用人单位的规章制度。如果迟到行为累计到严重违反规章制度，辞退无需支付经济补偿。
• 但如果迟到行为未达到严重程度，例如仅是偶尔迟到或迟到时间较短，辞退则可能被视为违法解除。

2. 公司是否履行告知和处罚程序

• 用人单位在以迟到为由辞退员工前，需明确告知员工迟到行为的严重性，并进行相应的处罚。如果公司未明确告知考勤制度或未对迟到行为进行处罚，直接辞退则可能构成违法解除。

3. 实际案例参考

• 某公司以员工一年内迟到98次为由辞退，但未明确告知考勤制度或进行处罚，法院认定公司违法解除劳动合同，需支付赔偿金。
• 另一案例中，员工因连续30天内迟到三次被辞退，法院认为符合严重违反规章制度，公司无需支付经济补偿。

4. 补偿金额

• 如果被认定为违法解除劳动合同，员工可要求经济补偿，标准为每工作满一年支付两个月工资。

总结

迟到被扣钱后辞退是否需要补偿，取决于迟到行为的严重性及公司处理流程的合法性。建议员工在面临辞退时，先确认公司规章制度是否合理、自身行为是否达到严重违纪程度，必要时可寻求法律援助，以维护自身权益。