中国第二历史档案馆是集中典藏​​1912至1949年中华民国时期历届中央政权机关及其直属机构档案​​的国家级档案馆，​​馆藏总量超258万卷​​，涵盖政治、经济、军事、文化等各领域，​​尤以孙中山手稿、南京大屠杀史料、民国政要个人档案等珍品著称​​。其核心馆藏可分为以下五类：

1. ​​南京临时政府及南方革命政权档案​​
   包括1912年孙中山建立的中华民国临时政府原始文件，如亲笔批示、签发令等，虽仅存百余卷但历史价值极高；1917年至1927年护法军政府、广州大元帅府等南方政权档案近700卷，记录北伐战争等重大事件。

2. ​​民国北京政府档案​​
   1912-1928年北洋政府时期112个全宗档案，涉及袁世凯、段祺瑞等执政时期的行政文书、外交条约等，虽因战乱损毁严重，仍为研究军阀混战史的关键材料。

3. ​​南京国民政府档案​​
   馆藏主体部分达1010个全宗，包括国民政府（总统府）、五院及各部委档案，完整呈现1927-1949年国民党执政期间的经济建设、军事行动、教育政策等，如工厂内迁、台湾光复等原始记录。

4. ​​日伪政权档案​​
   158个全宗详实记载1931年后日本在华扶植的伪满洲国、汪伪政权等活动，包括沦陷区统治政策、资源掠夺文件，是揭露侵华罪行的铁证。

5. ​​特藏档案库珍品​​
   500平方米特藏库集中保管1万余件稀世档案，如蒋介石日记、冯玉祥印章、民国邮票钞票、名人字画等兼具文物与史料价值的实物，部分为全球孤本。

该馆通过数字化扫描、编研出版《中华民国史档案资料汇编》等200余种史料，持续推动民国档案的开放利用。无论是学术研究、历史考证，还是爱国主义教育，这里都是探寻民国历史真相的宝库。