根据《劳动合同法》及《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，员工病假申请未被批准后，公司直接以旷工为由开除属于违法行为。以下是具体分析及建议：

一、核心结论

公司无权因病假未批直接开除员工 ，若以此为由解除劳动合同，可能面临劳动仲裁或赔偿要求。

二、法律依据

1. 医疗期保护

   员工因病或非因工负伤享有3个月至24个月的医疗期，具体时长根据工作年限确定。在医疗期内，用人单位不得解除劳动合同。

2. 审批与旷工区分

   • 审批权 ：公司仅能审核病假材料，无权直接批准或拒绝。

   • 旷工认定 ：需员工未履行请假手续且无正当理由缺勤，如未及时补假或提供虚假证明。

三、处理建议

1. 保留医疗证明

   员工应保存医院诊断书、病历等材料，作为后续**的依据。

2. 沟通与协商

   首先向公司说明情况，提供真实材料要求批准。若公司仍拒绝，可要求书面确认。

3. 投诉与仲裁

   • 向劳动监察部门投诉，要求认定公司行为违法。

   • 若涉及解除劳动合同，可申请劳动仲裁，要求支付赔偿金（按经济补偿标准的2倍计算）。

四、例外情形

若员工存在以下情况，公司可能按旷工处理：

• 提交虚假病假证明或材料；

• 医疗期已满且拒绝返岗。

五、注意事项

• 公司的考勤制度不得与《劳动合同法》冲突，如规定“连续旷工3天可解聘”需符合法定程序。

• 建议员工与用人单位签订《员工补充协议》，明确病假补办时限（如2天内补假）。

通过以上措施，员工可有效维护自身权益，避免因公司不当处理面临失业风险。