省直待遇比市直低的原因主要有以下几点：

1. 地理位置因素 ：

省直单位通常位于相对偏远的地区，而市直单位则位于人口、经济或文化中心城市。因此，市直单位所处的工作环境和条件可能更好，福利待遇也更高。

2. 组织形态因素 ：

省直单位通常是省份级别的机构，而市直单位则是市级别的机构。在一些情况下，市直单位的组织形态和规模更大，具有更强的绩效考核等优势，可能会获得更高的福利待遇。

3. 人才结构因素 ：

某些行业领域，市直单位往往更加需要高端、专业人才，因此为了吸引和留住这些人才，市直单位的待遇水平也会更高。

4. 经济发展水平 ：

省直单位的工资是按照全省财税收入的平均水平确定的，而市直单位的工资是按照本市行政区划范围内整个财税收入的平均水平确定的。经济强市的工资会更高一些，因此省直的工资可能会低于排在全省前三名的市直单位的工资总额。

5. 平台空间不同 ：

省直部门级别高，一般都是正厅级以上单位，职业前景较好。而市直部门大部分部门都是正县级，天花板较低，晋升相对困难。

6. 工资待遇差异 ：

省直部门虽然和当地公务员相比基本工资差不多，但奖金等额外收入较少。而市直部门在财政较好的地方可以做到足额准时发放奖金，绩效考核奖等也较为丰厚。

7. 工作环境和生活配置 ：

省直部门通常在省会，医疗、就医、购物等生活便利性较高，幸福指数也相对较高。而市直部门在这些方面可能不如省直部门。

综上所述，省直待遇比市直低的原因主要涉及地理位置、组织形态、人才结构、经济发展水平、平台空间、工资待遇以及工作环境和生活配置等多个方面。具体待遇差异还需根据不同的行业领域、地理位置和组织形态等因素进行具体分析。