农村合作医疗（新农合）和居民医疗保险的主要区别在于参保对象、报销比例及保障范围：前者针对农村户口，乡镇报销比例高但药品目录较少；后者覆盖城乡户口，住院和大病报销优势更明显，且药品目录更广。

1. 参保对象不同
   农村合作医疗主要面向农村户籍居民，通常需以家庭为单位参保；居民医疗保险则整合了城乡户籍，包括非农业户口人员，覆盖范围更广。

2. 报销比例与范围差异

   • 农村合作医疗：乡镇卫生院报销比例高（可达80%），起付线低，但市级以上医院报销比例较低（约10%-60%），药品目录有限。
   • 居民医保：住院和大病报销比例更高（平均85%），药品目录更全面，尤其对慢性病和特殊门诊的保障更完善。

3. 保障侧重点
   农村合作医疗侧重基层医疗需求，门诊待遇较优；居民医保则强化住院和大病保障，兼顾普通门诊，互济性更强。

4. 缴费与可持续性
   农村合作医疗费用低（年缴约200元），需每年续保；居民医保缴费较高，但部分城市允许累计缴费年限后终身享受待遇。

总结：农村合作医疗适合常驻农村、侧重基层医疗的人群；居民医保则更适合城乡流动人口或需更高报销保障的群体。根据自身医疗需求与户籍情况选择即可。