存款超过100万并非一律被严查，但银行会根据交易背景、账户流水和资金来源进行风控评估。只要资金合法且符合日常交易规律，通常不会引发特殊调查。

1. 银行风控的核心逻辑
   银行对大额交易的监控主要基于反洗钱和风险防范需求，而非单纯针对金额。若账户历史流水较高（如企业账户或高净值客户），单笔100万可能被视为正常交易；反之，若账户平时余额较低，突然存入大额现金，银行可能要求补充资金来源证明。

2. 合法收入无需担忧
   只要资金来源于工资、投资收益、房产出售等合法渠道，并能提供相应凭证（如合同、税单），即使被询问也可快速澄清。银行调查仅是流程，不代表资金存在问题。

3. 监管规定的实际执行
   现行法规要求对单笔或累计超50万（私对公/私对私）的交易进行登记，但“登记”不等于“严查”。银行需上报可疑交易，而正常合法交易通常不会进一步干预。

总结：存款超100万是否被查，取决于资金合规性与账户交易习惯。保持透明合法的财务记录，即可避免不必要的麻烦。