根据北京小升初政策，北京户口但学籍不在北京的情况有以下处理方式：

一、升学资格依据

1. 户籍优先原则

   北京户籍学生升学以户籍所在地和家庭实际居住地址为主要依据。若户籍与学籍在同一区域，学生可直接在户籍或居住地所在区参加小升初。

2. 跨区升学条件

   若户籍与学籍不在同一区，学生需满足以下条件之一：

   • 全家户口在目标区；

   • 在目标区有合法稳定住所并取得居住证；

   • 在目标区有务工就业证明。

二、跨区升学流程

1. 申请与审核

   • 父母向毕业学校提交跨区入学申请，经学校初审后转出区教育部门审核，通过后信息将推送至转入区。

2. 材料准备

   需提供：

   • 全家户口簿、身份证原件及复印件；

   • 在京务工就业证明、实际居住证明、北京市居住证等“四证”。

三、特殊情况说明

1. 高考报名

   • 北京户籍学生即使学籍在外地，仍可回户籍地参加高考，以户籍为准。

   • 非京籍学生需满足“四证”要求，但高考报名仍以户籍地为准。

2. 转学限制

   • 毕业年级（如初三）无法转学；

   • 转学需提前联系目标学校并提交申请，经教委审核后方可办理。

四、其他注意事项

• 学籍转移 ：跨区转学需符合目标区教育部门规定，部分学校（如优质高中）可能对学籍来源有额外要求。

• 民办学校选择 ：若对公办学校有顾虑，可优先选**办学校，其招生政策相对灵活。

建议家长根据实际情况提前咨询目标学校及教委，确保材料准备充分。