公务员请病假三个月一般不会被扣工资。

根据《中华人民共和国公务员法》的规定，公务员在法定工作日之外加班的，应当给予相应的补休，不能补休的按照国家规定给予补助。而病假属于法定的带薪假期，公务员在病假期间，工资待遇不受影响。

具体分析如下：

1. 带薪病假权利：公务员作为国家公职人员，依法享有带薪病假的权利。根据相关规定，公务员在病假期间，其工资福利待遇按照国家规定执行，一般不会被扣发。

2. 病假时长与工资：通常情况下，公务员请病假的时间长短与工资待遇没有直接关系。只要符合病假的申请条件和程序，无论病假时间是几天还是几个月，公务员的工资都应按照正常标准发放。

3. 特殊情况：在某些特殊情况下，如公务员长期病假且无法正常履行工作职责，可能需要根据具体情况进行工资调整。但这种调整通常需要经过严格的审批程序，并且会充分考虑公务员的实际情况和相关政策规定。

总结：公务员请病假三个月一般不会被扣工资，这是他们依法享有的带薪病假权利。当然，具体情况可能因地区、部门和个人而异，如有疑问，建议直接咨询相关部门或专业人士。