‌古代负责为皇帝查案的部门主要是刑部、大理寺和御史台（明清时期改为都察院），这三个机构合称"三法司"，构成了中国古代最权威的司法监察体系。‌其中刑部主管全国刑名案件，大理寺负责复核重大案件，御史台/都察院则行使监察百官和参与会审的职能。这套制度从隋唐确立后不断完善，成为维护皇权统治的重要工具。

1. ‌刑部——司法执行核心‌
   作为六部之一，刑部是中央最高司法行政机关，下设十三清吏司分管各省案件。主要职责包括：审理地方上报的死刑案件、制定律法实施细则、管理监狱系统。明代增设"十三道"监察体系后，刑部权力进一步扩大，可直接审理涉及官员的重大案件。

2. ‌大理寺——审判复核机构‌
   创设于北齐时期的大理寺专门负责复审刑部判决的重大案件，具有"慎刑"的职能特点。其长官大理寺卿位列九卿，与刑部尚书、都御史共同参与"三司会审"。唐代确立的"三复奏"制度要求死刑必须经大理寺三次复核才能执行，体现了对司法权的制衡。

3. ‌御史台/都察院——皇权耳目‌
   汉代设立的御史台在明代演变为都察院，作为皇帝直属的监察机关，具有"代天子巡狩"的特殊地位。御史不仅监督司法审判过程，还能直接查办谋反、贪污等重案，著名的"绣衣直指"就是持节查案的钦差御史。清代都察院下设六科给事中，形成对六部工作的垂直监督。

这套三法司制度通过分工协作与相互制约，既保证了重大案件的审理质量，又强化了中央集权。值得注意的是，遇到特别重大的政治案件时，皇帝常会临时指派锦衣卫、东厂等特殊机构介入，这反映了古代司法体系最终服务于皇权的本质特征。