工程亏损导致欠甲方工程款时，核心解决思路是：优先协商争取缓冲期，同步梳理财务与合同条款，必要时通过法律手段止损，并优化管理避免重蹈覆辙。

1. 主动协商，争取还款缓冲
   立即与甲方坦诚沟通，说明亏损原因及当前资金困境，提出分期还款或延期支付方案。书面协议明确还款计划，避免单方面违约风险。若甲方同意调整付款条件，可缓解短期压力并为后续处理争取时间。

2. 全面梳理财务与合同
   核查项目账目，明确亏损金额及原因（如成本超支、设计变更等），同时审查合同条款，确认甲方是否存在违约行为（如未按时支付进度款）。若合同约定不清或甲方有责，可据此协商减免部分债务或索赔。

3. 法律手段与资产处置
   若协商无果，需通过法律途径**：

   • 诉讼/仲裁：提交合同、结算单等证据，主张工程款债权；
   • 财产保全：申请冻结甲方资产以确保执行；
   • 代位权协议：让材料商直接向甲方追讨欠款，减少自身垫资风险。

4. 优化管理并预防风险
   亏损后需复盘项目管理漏洞，例如加强成本控制、签订更严谨的合同条款、预留应急资金等。长期可通过税务抵扣（如认证亏损额抵减利润）降低损失，并建立风险预警机制。

提示：处理过程中务必保留所有财务凭证和沟通记录，必要时咨询专业律师或财税顾问，确保合法合规解决问题。