工资可以晚两个月发放，但在申报个人所得税时应根据实际发放月份进行申报，而不是按照原本计划的发放时间。这意味着即使工资延迟发放，税务处理依然要依据“收付实现制”原则，即在工资实际支付给员工的当月进行税款的计算和申报。

理解工资发放与个税申报的基本规则至关重要。根据规定，扣缴义务人应在实际支付工资的当月向税务机关申报并代扣代缴个人所得税，并在次月15日前完成申报流程。如果工资推迟发放，则相应的个税也应当随着工资的实际发放而调整。在工资隔月发放的情况下，需要将补发工资分摊到所属月份的工资薪金所得中合并计算缴纳个人所得税。

对于因特殊情况导致工资延迟发放的企业来说，及时通知员工是非常必要的。这不仅有助于避免误解，还能确保员工了解其个税的准确申报情况。企业还应该准备书面说明，详细记录工资延迟发放的原因、涉及的具体金额以及如何将其分配到相应的纳税期间，以便于后续审计或检查时提供证据支持。

针对工资延迟发放可能引发的一系列问题，如员工对个税扣除产生疑问或不满，公司需提前制定沟通策略。例如，通过内部公告或者一对一会议的形式，解释为何会出现这种情况，以及公司将采取哪些措施来纠正这种状况。强调即便工资延迟发放，但个税申报仍严格遵循法律法规的要求执行。

总结而言，虽然工资可能会因为各种原因而延迟发放，但这并不影响个人所得税按照实际发放的时间点来进行申报的原则。企业必须确保所有财务操作透明化，并且与员工保持良好的沟通渠道，以维护双方的信任关系。企业在处理此类事务时务必遵守相关法律法规，保证税务申报工作的合规性和准确性。这样做不仅能有效保护企业和员工的利益，同时也促进了健康和谐的工作环境。