公司罚款1000元能赔偿多少，主要取决于罚款的性质、公司的规章制度以及相关法律法规的规定。一般来说，赔偿金额可能从几千元到几万元不等，具体情况需要根据以下因素进行分析：

1. 1.罚款的性质和原因需要明确公司罚款1000元的性质和原因。不同性质的罚款对应不同的赔偿标准。例如，如果是因员工违反公司规章制度而被罚款，那么赔偿金额可能会根据规章制度中规定的罚款比例进行计算。如果罚款是由于公司单方面的不合理行为导致的，那么赔偿金额可能会更高，甚至可能涉及精神损失赔偿。
2. 2.公司的规章制度公司的规章制度是处理此类问题的关键依据。许多公司会在员工手册或劳动合同中明确规定罚款和赔偿的相关条款。如果公司罚款1000元的行为符合公司规章制度的规定，那么赔偿金额可能会按照规定的比例进行计算。例如，某些公司规定罚款金额的数倍作为赔偿金，那么赔偿金额可能是罚款金额的2到5倍。
3. 3.相关法律法规除了公司内部的规章制度外，相关法律法规也是决定赔偿金额的重要因素。例如，《劳动合同法》等相关法律对用人单位罚款和赔偿问题有明确规定。如果公司罚款行为违反了相关法律法规，赔偿金额可能会根据法律规定进行计算。如果罚款行为对员工造成了实际的经济损失或精神损害，员工还可以通过法律途径要求公司进行相应的赔偿。
4. 4.协商和调解在实际操作中，赔偿金额的确定往往还需要通过协商和调解来解决。员工可以与公司进行沟通，表达自己的诉求和理由，争取合理的赔偿。如果双方无法达成一致，员工可以寻求劳动仲裁或法律诉讼的帮助。在仲裁或诉讼过程中，仲裁员或法官会根据具体情况和证据，作出公正的裁决。
5. 5.其他因素除了上述因素外，还有一些其他因素可能会影响赔偿金额的确定。例如，员工的工龄、职位、工资水平以及公司的财务状况等，都可能在一定程度上影响赔偿金额的最终确定。公司的声誉和形象也可能成为公司考虑赔偿金额的一个因素。

公司罚款1000元能赔偿多少并没有一个固定的答案，需要综合考虑罚款的性质、公司的规章制度、相关法律法规以及协商和调解的结果。如果遇到此类问题，建议员工首先了解公司的相关规定，并与公司进行积极沟通，必要时可以寻求法律专业人士的帮助，以维护自身的合法权益。