签了保密协议仍可依法举报公司违法行为，关键在于举报内容是否涉及受法律保护的商业秘密。若举报事项属于公司违法活动（如偷税漏税、违规操作等），保密协议不得限制公民行使举报权，且违法条款本身无效。

1. 保密协议的合法边界
   保密协议仅对合法的商业秘密（如技术专利、客户数据等）具有约束力。若协议试图掩盖违法行为（如财务造假、环境污染等），相关条款因违反法律而自动失效，员工举报不受协议限制。

2. 举报内容的区分标准

   • 可举报事项：与公共利益或法律强制规定相关的违法行为（如劳动侵权、贪污受贿等），即使签了保密协议也可向监管部门实名或匿名举报。
   • 受限事项：若涉及企业核心商业秘密（如未公开的产品配方），需通过合法途径（如司法举报）避免泄密风险。

3. 法律对举报者的保护
   我国《劳动法》《反不正当竞争法》均明确，员工因举报违法行为遭受报复的，可主张赔偿。举报人有权要求保密个人信息，企业不得以违反保密协议为由进行处罚。

总结：保密协议不是违法行为的“保护伞”，员工应勇敢行使举报权，但需注意区分举报内容性质，必要时寻求法律协助以保障自身权益。