‌医保基金打包付费后主要面临三大问题：支付标准难确定、医疗机构控费压力大、患者服务质量可能下降。‌这种预付制支付方式虽然能控制医疗费用过快增长，但在实际运行中仍存在不少挑战。

1. ‌支付标准测算困难‌
   打包付费需要科学测算病种或人群的合理费用标准，但我国地区差异大、医疗数据不完善，导致标准难以精准制定。部分地区出现支付标准过高造成基金浪费，或标准过低导致医院亏损的情况。

2. ‌医疗机构控费风险转嫁‌
   部分医院为控制成本可能减少必要服务，如推诿重症患者、缩短住院天数、降低药品耗材质量等。个别机构甚至通过"诊断升级"（将轻症归入高付费病组）套取医保基金。

3. ‌医疗质量监管难度增加‌
   预付制下，医院可能更关注成本而非疗效，导致过度压缩服务。需建立配套的质量评估体系，但目前多数地区缺乏有效的动态监测手段，患者满意度与临床结局指标易被忽视。

4. ‌信息系统支撑不足‌
   打包付费依赖精准的病案首页数据和临床路径管理，但基层医院信息化水平参差不齐。存在疾病分组错误、费用归类偏差等问题，影响结算公平性。

医保基金打包付费改革需配套完善动态调整机制、智能审核系统和绩效考核标准，平衡控费目标与医疗质量。未来应通过大数据分析优化病组定价，同时加强医疗机构行为监管，避免"一刀切"带来的负面效应。