公司一个月扣两个月的社保费用，通常发生在员工入职首月，可能由以下原因导致：员工参保时间较晚、代扣银行卡扣除多家社保费用或社保数据重复发送银行。若员工发现扣款异常，应首先与单位沟通了解具体情况，必要时可向社保局或劳动监察部门咨询。

可能原因

1. 参保时间问题：部分员工在入职后未及时完成社保参保手续，导致社保系统未能及时记录，从而产生重复扣款。
2. 代扣银行卡问题：如果员工在同一银行账户下关联了多家单位的社保代扣业务，可能因系统识别错误导致重复扣款。
3. 数据传输问题：社保数据在传输过程中可能出现重复发送至银行的情况，导致当月扣款金额异常。

员工应对措施

1. 核实扣款明细：员工可要求单位提供详细的扣款清单，确认是否存在重复扣款或错误扣款。
2. 与单位沟通：向单位人力资源部门反映问题，了解扣款的具体原因。
3. 咨询相关部门：如问题无法解决，可拨打社保服务热线或向当地劳动监察部门咨询，维护自身权益。

法律依据

根据《社会保险费申报缴纳管理规定》，用人单位需依法为员工缴纳社保费用，员工有权核查扣款明细，如发现违规扣款，可向相关部门举报。

总结

公司一个月扣两个月的社保费用并非普遍现象，多与特殊情况有关。员工在遇到类似问题时，应主动与单位沟通并核实情况，必要时寻求法律帮助，以保障自身权益。